Die Geschichte der Luftfahrt auf Mallorcas beginnt am 2. Juli 1916 mit der Landung eines von Hedilla geführten Flugzeugs auf dem Prado de Son Sunyer. Einige Jahre später, im Frühling 1921, bietet der Pilot Manuel Colomer einige Flugvorführungen mit seinem Aviatick-Flugzeug an, zunächst auf den Feldern von Son San Juan, danach auf Son Bonet.
Während das erstgenannte Gelände als Flugplatz für kommerzielle Flüge genutzt wird, richtet Colomer in Son Bonet einen Privatflugplatz ein, der von ihm und seinen Pilotenkollegen für Flugtaufen und Ausflüge über die Insel benutzt wird. Im Mai 1935 wird eine Flugschule eröffnet, die zum Flugsportverein von Palma de Mallorca gehört.
Nach Beginn des Bürgerkriegs verlängert die Fluggesellschaft Iberia – die landesweite Flugdienste anbietet – am 11. Juli 1936 ihre Fluglinie Salamanca-Burgos-Zaragoza bis nach Mallorca. Iberia verwendet Junker Flugzeuge des Typs JU-52, die auf dem Flughafen Son Bonet abgewickelt werden, da Son San Juan der militärischen Luftfahrt dient. Im Februar 1939 wird diese Fluglinie in die Linie Vitoria-Barcelona-Palma verwandelt und zwei Monate später in die Linie Vitoria-Zaragoza-Barcelona-Palma.
Im Mai 1946 wird San Bonet zum Zollflughafen und im Juli offiziell für den nationalen und internationalen Flugverkehr geöffnet. In diesem Jahr benutzen 18.000 Fluggäste die Linie Valencia-Palma, die von Iberia angeboten wird. Zu dieser Zeit verfügt Son Bonet über zwei Start- und Landebahnen auf natürlichem Gelände, einem kleinen Tower mit Boden/Luft-Kommunikation und einem Funkpeiler.
Erste Veränderungen
Bis 1953 hat sich der Verkehr auf ein Zehnfaches erhöht, und auf dem Flughafen werden mit der Befeuerungsinstallation auf einer der Start- und Landebahnen und Landelichtern an beiden Startbahnköpfen die ersten Modernisierungsarbeiten vorgenommen. Das kleine Abfertigungsgebäude verfügt über eine permanente Zoll- und Polizeidienststelle, Taxitransport und Straßenbahnen. Die durchgehende Öffnung des Flughafens Son Bonet für den Flugverkehr erfolgt im April 1955.
Ein Jahr später wird die erste Flugfelderweiterung vorgenommen und 1957 die Vergrößerung der Fluggasthaltestelle In diesem und im folgenden Jahr fliegen fast zwei Dutzend Fluggesellschaften Palma unregelmäßig an, 1961 sind es schon über fünfzig.
Der zunehmende Verkehr und die fehlende Möglichkeit einer Erweiterung von Son Bonet treiben den Bau eines großen kommerziellen Flughafens auf dem Luftstützpunkt Son San Juan an. Nach der Veröffentlichung der Begrenzungen des Flughafengeländes und den Anlagen von Son Bonet im Juli 1959 wird der kommerzielle Verkehr von diesem Flughafen nach Son San Juan verlegt.
Im Oktober 1989 wird der Flugplatz Son Bonet, der seit 1981 als Anlage von Interesse der nationalen Verteidigung angesehen und von der Behörde für zivile Luftfahrt verwaltet wurde, in die autonome öffentliche Einrichtung staatlicher Flughäfen (Organismo Autónomo Aeropuertos Nacionales) (Vorläufer von Aena) aufgenommen. Diese Behörde ist verantwortlich für das Management und die Aufrechterhaltung als nicht kontrollierter Flughafen dritter Kategorie, in dem heutzutage der allgemeine Zivil- und Sportluftverkehr der Insel Mallorca angesiedelt ist.